Поняття конфлікту від початку грало центральну роль розвитку психоаналітичного вчення. Психоаналіз розвинувся на основі теорії особистості та методів її лікування, і для цього розроблені загальні психодинамічні основи психотерапії та спеціальні раціонально орієнтовані та конфліктцентровані підходи.
Як поводиться лікар і пацієнт під час психотерапії, лише зовні відповідає «розмові» у звичному значенні. Образ дій та цілі тут інші. Мета аналітично орієнтованої психотерапії полягає в тому, щоб досягти важкодоступних областей, особливо неусвідомлених емоційних процесів у міжлюдських відносинах. Для цього хворому пропонують викладати і висвітлювати спонтанні думки, які йому спадають на думку, не обираючи того, що йому самому здається непотрібним і болісним. Так, хворий може згадувати епізоди свого минулого життя та своєї поведінки, які були витіснені у несвідоме. Цим вільним асоціаціям пацієнта відповідає з боку терапевта вільна увага. При цьому лікар багато в чому більш стриманий і пасивний, ніж за інших форм відносин лікар-пацієнт. Він діє як каталізатор, який цим «перенесенням» дає хід чи стримує їх без того, щоб самому на них активно впливати. Шляхи до несвідомого відкриває аналіз поведінки: що хворий повідомляє про свою повсякденну поведінку, особливо про спільне життя зі своїми близькими, і що він може повідомити лікаря про свою поведінку. У цьому увагу звертається такі помилкові форми поведінки, як ненавмисні застереження; оскільки ці помилкові дії невипадкові, вони визначаються витісненими несвідомими імпульсами.
Наступний шлях до несвідомого – аналіз сновидінь. Якщо уявлення та почуття, що переживаються у сновидінні, перекладаються мовою символів, то аналізі сновидінь відбувається перехід до первісного змісту символічних висловлювань. Фрейд бачив у тлумаченні сновидінь основний сенс аналізу, сьогодні домінує аналіз поведінки та взаємовідносин.
Те, що випливає з асоціацій, поведінки, помилкових дій, в результаті інтерпретації, або тлумачення, перетворюється на зміст свідомості і стає корисним для лікування. Цьому хворий (знову таки несвідомо) пручається, щоб не торкатися свого статусу невротичного компромісу у можливій постановці питання. Опір хворого проявляється багато в чому в його поведінці, особливо щодо терапевта. Це як перенос. Під переносом мається на увазі наступне: колишні переживання та вчинки переносяться на іншу особу, в даному випадку на терапевта. Це може бути, наприклад, «нове обтяження стосунками батька та матері, яке лежало в основі ранніх переживань у дитинстві».
Переноси постійно констатуються у всіх видах психотерапії, у психоаналітично орієнтованих терапіях є засобом лікування, оскільки перенесення дає можливість пожвавити раніше невирішені конфлікти знову, наново їх пережити, переробити у відносинах і наскільки можна позитивно дозволити. Терапевт є для хворого той світ, який був йому досі недоступний. Цьому протистоять із зазначених причин несвідомі сили, так званий опір перенесення.
Терапевт повинен дбати про те, щоб реагувати у своїх відносинах з хворим відповідним чином, щоб «у своєму ставленні до хворого бути невільним від своїх власних (його, лікаря) особистісних особливостей, коріння яких лежить у його власних установках». Такий контрперенос, тобто. емоційна відповідь терапевта на поведінку хворого може емоційно гальмувати лікування, якщо він залишається нерозпізнаним і неконтрольованим. Лікування, як і перенесення, потребує ретельного контролю, можливо за допомогою іншого досвідченого психотерапевта.
Коли опір та перенесення визначені, першорядним психотерапевтичним завданням стає їхній аналіз. Він користується тлумаченням (інтерпретацією): «те, що буде перероблено, стане з прихованого сенсу прозорим і зрозумілим. Завдяки тлумаченню, здавалося б, безглузде стає осмисленим, штучно розірване повертає свої природні зв'язки, неясне стає ясним, чуже набуває довіри і необдумане чи залишене поза увагою набуває нового і динамічного значення».
Тлумачення стає осмисленим лише тоді, коли пацієнт спроможний його емоційно зрозуміти, коли він сам стоїть близько до розпізнавання цих смислових зв'язків. Занадто поспішне тлумачення марно. "Золоте правило" говорить: що, як, про що. Це означає: шляхом тлумачення пояснити хворому, що він витісняє; далі-як це вийшло і, нарешті, про який зміст йдеться. Словесно тлумачення повинні підходити до рівня світу думок та уявлень кожного хворого. Всі професійні висловлювання необхідно виключити: хворий не повинен ці положення вивчити раціонально, а його знання має привести його до потрібного висновку.